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Acide aminé


Un acide aminé est une molécule, contenant les groupes fonctionnels de type amine et acide carboxylique. Les protéines sont constituées d'un grand nombre d'acides aminés (plus de 100) reliés de manière covalente au moyen de fonctions amide (liaison peptidique). Si le nombre d'acides aminés est inférieur à 20, on parle de peptide, et de 20 à 100 de polypeptide. Attention une erreur s'est glissée dans le tableau, il faut lire : Lys/K


Tableau présentant les 20 acides aminés représentés dans le code génétique
image:amino_acids_2.png


Propriétés chimiques

Propriétés de la chaîne latérale:

Abrev. Nom Type de chaîne latérale Masse pI pK1(α-COOH) pK2(α-+NH3) pKr (R) Remarques
A Ala Alanine hydrophobe 89.09 6.11 2.35 9.87
C Cys Cystéine hydrophile 121.16 5.05 1.92 10.70 8.37 Deux cistéines peuvent former un pont disulfure, ce qui renforce la structure tertiaire de certaines protéines, comme l'insuline par exemple.
D Asp Acide aspartique acide 133.10 2.85 1.99 9.90 3.90
E Glu Acide glutamique acide 147.13 3.15 2.10 9.47 4.07
F Phe Phénylalanine hydrophobe 165.19 5.49 2.20 9.31
G Gly Glycine hydrophile 75.07 6.06 2.35 9.78
H His Histidine base 155.16 7.60 1.80 9.33 6.04
I Ile Isoleucine hydrophobe 131.17 6.05 2.32 9.76
K Lys Lysine basique 146.19 9.60 2.16 9.06 10.54
L Leu Leucine hydrophobe 131.17 6.01 2.33 9.74
M Met Méthionine hydrophobe 149.21 5.74 2.13 9.28 C'est toujours le premier acide aminé d'une protéine.
N Asn Asparagine hydrophile 132.12 5.41 2.14 8.72
P Pro Proline hydrophobe 115.13 6.30 1.95 10.64
Q Gln Glutamine hydrophile 146.15 5.65 2.17 9.13
R Arg Arginine basique 174.20 10.76 1.82 8.99 12.48
S Ser Serine hydrophile 105.09 5.68 2.19 9.21
T Thr Thréonine hydrophile 119.12 5.60 2.09 9.10
V Val Valine hydrophobe 117.15 6.00 2.39 9.74
W Trp Tryptophane hydrophobe 204.23 5.89 2.46 9.41
Y Tyr Tyrosine hydrophile 181.19 5.64 2.20 9.21 10.46


Acide
Aminé
hydrophobe positif négatif polair chargé petit tout petit aromatique aliphatique Volume de van der Waals
Ala X - - - - X X - - 67
Cys X - - - - X - - - 86
Asp - - X X X X - - - 91
Glu - - X X X - - - - 109
Phe X - - - - - - X - 135
Gly X - - - - X X - - 48
His X X - X X - - X - 118
Lys X X - X X - - - - 135
Ile X - - - - - - - X 124
Leu X - - - - - - - X 124
Met X - - - - - - - - 124
Asn - - - X - X - - - 96
Pro - - - - - X - - - 90
Gln - - - X - - - - - 114
Arg - X - X X - - - - 148
Ser - - - X - X X - - 73
Thr X - - X - X - - - 93
Val X - - - - X - - X 105
Trp X - - X - - - X - 163
Tyr X - - X - - - X - 141


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