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Les eucaryotes (du grec eu, vrai et caryon, noyau) constituent un groupe d'organismes unicellulaires ou pluricellulaires définis par leur structure cellulaire. C'est un des trois domaines du vivant.
Eucaryotes ├───Opisthocontes │ ├────Mycètes │ │ ├────────────────────Eumycètes │ │ └────────────────────Microsporidies │ └────Choano-organismes │ ├────────────────────Choanoflagellés │ └────────────────────Métazoaires l'ancien règne animal ├───Lignée brune │ ├──────────────────────────────Haptophytes │ └────Straménopiles │ ├────────────────────Phéophycées │ ├────────────────────Bacillariophycées │ ├────────────────────Chrysophycées │ ├────────────────────Xanthophycées │ ├────────────────────Eustigmatophycées │ ├────────────────────Rhaphidophycées │ ├────────────────────Dictiophycées │ └────────────────────Oomycètes ├───lignée verte │ ├──────────────────────────────Glaucophytes │ └────Métabiontes │ ├──────Rhodobiontes │ └──────Chlorobiontes │ ├─────────Ulvophytes │ └────┬────Charophytes │ └───Embryophytes ├─────────────────────────────────────────Actinopodes ├───Alvéolobiontes │ ├──────────────────────────────Apicomplexés │ ├──────────────────────────────Ciliés │ └──────────────────────────────Dinophytes ├─────────────────────────────────────────Chlorarachniophytes ├─────────────────────────────────────────Cryptophytes ├─────────────────────────────────────────Euglénobiontes ├─────────────────────────────────────────Foraminifères ├─────────────────────────────────────────Métamonadines ├─────────────────────────────────────────Mycétozoaires ├─────────────────────────────────────────Parabasiliens ├─────────────────────────────────────────Percolozoaires └─────────────────────────────────────────Rhizopodes
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| Classification phylogénétique | |||||
| Domaine : Eukaryota | |||||
| Taxons de rang inférieur | |||||
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| Classification classique | |||||
| Animalia | |||||
| Fungi | |||||
| Plantae | |||||
| « Protista » | |||||
Les eucaryotes possèdent par opposition aux procaryotes (Archéobactéries et Eubactéries):
Classiquement les eucaryotes étaient subdivisés en 4 règnes Animalia, Fungi, Plantae et Protista. Si les trois premiers pouvaient
avoir un définition précise il n'en était pas de même pour le règne des protistes qui comprenait tout ce qui n'était pas animal,
végétal ou champignon. Au cours des dernières années les progrès en Systématique permettent bien que tout ne soit pas connu,
d'esquisser un arbre phylogénétique des eucaryotes. L'une des dernières synthèses francophone en date est celle proposée par
Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader dans Classification phylogénétique du vivant paru aux éditions Belin


