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Un système naturel est une entité complexe dans le temps et l'espace, dont les unités constitutives interragissent entre elles pour préserver l'intégrité, la
structure et le comportement du système plus vaste auxquelles elles appartiennent, système qu'elles tendent à restaurer après une
perturbation non destructrice, assurant par la même leur propre préservation.
Quelques exemples de systèmes naturels :
Ainsi, le système cellulaire eucaryote est-il constitué
d'une paroi cellulaire, d'un cytoplasme, d'un noyau, d'organites etc.,que le système organisme humain est constitué d'entités
telles que cœur, cerveau, muscles...
Bien que cela soit controversé, certains estiment que la planète Terre est un système naturel, constitué d'un ensemble d'écosystèmes : des écosystèmes marins, lacustres, montagnards,
urbains...
Selon de nombreux écologues, les systèmes naturels doivent respecter deux
lois :
Le système écosphérique est relativement stable à un moment donné, ce qui ne signifie pas qu'il n'a pas évolué. Au contraire, il est passé par de nombreux états successifs, chacun issu de l'état précédent, après une évolution. Le passage d'un état stable à un autre état stable ultérieur est en partie fonction de contraintes extérieures, telles que bombardements météoritiques, intensité de la radiation solaire etc.
Ce n'est qu'après diminution des chutes météoritiques et diminution des radiations, que la planète a pu se refroidir, se différencier et une convection mantelique apparaitre et finalement la vie apparaitre.
Aujourd'hui encore, les variations climatiques fonction de la variation de l'activité solaire, les chutes météoritiques peuvent aboutir à la réduction des surfaces occupées par certains biomes et eventuellement la disparition complète de certains écosystèmes, ainsi qu'en témoignent les disparitions d'écosystèmes lacustres pendant les périodes chaudes, l'extension des calottes glaciaires en période froide ou l'extinction totale d'espèces (voir l'hypothèse la plus couremment admise sur la disparition des dinosaures).
Dans les systèmes naturels, au fur et à mesure de leur évolution, on observe une complexification et une diversification
croissante.
L'augmentation de la complexité permet au système d'assurer son homéostasie dans des conditions données, alors que
l'accroissement de la diversité
l'aide à la conserver ou à la restaurer en cas de crise. L'accroissement de la complexité et de la diversité du système est
fortement dépendante de l'augmentation de la coopération entre les
parties constituantes.
Il existe d'autres définitions moins communes du terme et d'autres termes définissant le concept, comme le mot holon.


